MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16H

Total Repeats: 223

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021519	CATTT	2	10	1233	1242	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021519	AGTT	2	8	1294	1301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021519	TTTA	2	8	1317	1324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021519	TGT	2	6	1343	1348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021519	TCT	2	6	1354	1359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021519	GTA	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021519	AGG	2	6	1416	1421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021519	AGG	3	9	3938	3946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021519	TG	3	6	4795	4800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021519	CATTT	2	10	5492	5501	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021519	TGAAG	2	10	5531	5540	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021519	T	6	6	5559	5564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021519	TAA	3	9	5572	5580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021519	A	6	6	5683	5688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021519	CA	3	6	5740	5745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021519	GAT	2	6	5803	5808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021519	ATA	2	6	5813	5818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021519	ATTG	2	8	5828	5835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021519	A	7	7	5850	5856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021519	CTT	2	6	5934	5939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021519	TGA	2	6	5978	5983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021519	GTTA	2	8	6002	6009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021519	TG	3	6	9058	9063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021519	TTA	2	6	10283	10288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021519	TAT	2	6	10294	10299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021519	ATA	2	6	12485	12490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021519	AAT	2	6	13157	13162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021519	GTG	2	6	13245	13250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021519	ATA	2	6	13258	13263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021519	CAA	2	6	13268	13273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021519	A	6	6	13282	13287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021519	CAA	2	6	13291	13296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021519	GAA	2	6	13312	13317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021519	ACC	2	6	13345	13350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_021519	CTTT	2	8	13415	13422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021519	GCT	2	6	13429	13434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021519	TTCAA	2	10	13738	13747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021519	AATTG	2	10	13749	13758	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021519	T	6	6	13783	13788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021519	CAC	2	6	13807	13812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_021519	ATG	2	6	13843	13848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021519	AG	3	6	13852	13857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021519	TAA	2	6	15005	15010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021519	T	6	6	16255	16260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021519	TATT	2	8	16295	16302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021519	ACA	2	6	16303	16308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021519	AATA	2	8	16309	16316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021519	TAA	2	6	16385	16390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021519	ATTTA	2	10	16394	16403	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021519	AGT	2	6	16406	16411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021519	GTT	2	6	16451	16456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021519	AT	3	6	16515	16520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021519	AGG	2	6	16550	16555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021519	GTTG	2	8	16556	16563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021519	TTTAT	2	10	20368	20377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021519	ATTAT	2	10	20589	20598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021519	AGG	2	6	20601	20606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021519	CTT	2	6	22375	22380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021519	CT	3	6	22707	22712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021519	CA	3	6	22828	22833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021519	ATC	2	6	22876	22881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021519	ACC	2	6	22891	22896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021519	AAG	2	6	22921	22926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021519	CAA	2	6	22957	22962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021519	TCGT	2	8	22969	22976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021519	AGCA	2	8	23005	23012	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021519	TTA	2	6	23133	23138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021519	CAA	2	6	23148	23153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021519	A	6	6	23777	23782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021519	A	6	6	23784	23789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021519	AAATG	2	10	23858	23867	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021519	ATA	2	6	23879	23884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021519	CCT	2	6	25079	25084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_021519	TAGA	2	8	25199	25206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021519	T	6	6	25242	25247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021519	TAAG	2	8	25295	25302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021519	T	6	6	25513	25518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021519	GAT	2	6	25599	25604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021519	AAT	2	6	25666	25671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021519	ATT	2	6	25683	25688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021519	TTAA	2	8	25795	25802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021519	A	6	6	27245	27250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021519	CAA	2	6	28211	28216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021519	T	6	6	28223	28228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021519	ATA	2	6	28230	28235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021519	ATTTT	2	10	28246	28255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021519	GAT	2	6	28268	28273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021519	ACGC	2	8	28298	28305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021519	TG	3	6	28358	28363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021519	AGA	2	6	28426	28431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021519	TA	3	6	28752	28757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021519	TTGC	2	8	28768	28775	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021519	AGG	2	6	28823	28828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021519	TTC	3	9	29125	29133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021519	T	7	7	29144	29150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021519	TC	3	6	29173	29178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021519	AGTA	2	8	29179	29186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021519	CTA	2	6	29239	29244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021519	CCA	2	6	29266	29271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_021519	TCT	2	6	32057	32062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021519	TTG	2	6	32065	32070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021519	GTT	2	6	32083	32088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021519	GTT	2	6	32097	32102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021519	ACC	2	6	34601	34606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_021519	TGG	2	6	34627	34632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021519	ATTG	2	8	34638	34645	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021519	AAT	2	6	36656	36661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021519	ATTT	2	8	36666	36673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021519	ATA	2	6	36699	36704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021519	ATA	2	6	36711	36716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021519	ATTA	2	8	37120	37127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021519	A	7	7	37136	37142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021519	T	7	7	37160	37166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021519	ATA	2	6	38341	38346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021519	A	6	6	38348	38353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021519	AGC	2	6	38419	38424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021519	A	6	6	38483	38488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021519	GCTA	2	8	38583	38590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021519	ACT	2	6	38599	38604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021519	AGT	2	6	38608	38613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021519	CATA	2	8	38688	38695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021519	GTGG	2	8	38726	38733	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021519	TTTG	2	8	38746	38753	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021519	TGTT	2	8	38781	38788	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021519	TAAA	2	8	38820	38827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021519	A	6	6	38829	38834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021519	GAA	2	6	38872	38877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021519	TGA	2	6	38924	38929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021519	TTTAAT	2	12	39019	39030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021519	T	6	6	39066	39071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021519	GTG	2	6	39078	39083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021519	TTGG	2	8	40676	40683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021519	GTT	2	6	40729	40734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021519	TTA	2	6	40738	40743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021519	CTC	2	6	40778	40783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_021519	AGT	2	6	40872	40877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021519	TGA	2	6	40890	40895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021519	AGT	2	6	40898	40903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021519	AGGA	2	8	43534	43541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021519	TAT	2	6	43544	43549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021519	TGG	2	6	43580	43585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021519	ACCT	2	8	43591	43598	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021519	CAAA	2	8	43601	43608	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021519	GC	3	6	43681	43686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021519	T	6	6	43688	43693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021519	GTC	2	6	43708	43713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021519	GTA	2	6	43717	43722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021519	GGA	2	6	44799	44804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021519	AGAA	2	8	48786	48793	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_021519	A	6	6	59467	59472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_021519	TA	3	6	59483	59488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.